ASRtriala--------免费R包--------助力您完成田间试验分析
(相关资料图)
ASRtriala介绍
英国VSNI全球技术中心最新研发推出了一系列免费R包,包括:
基因组选择的利器:ASRgenomics包介绍(免费R包)
ASRgwas包:一个可以考虑多个随机因子的免费GWAS分析包
今天介绍另外一款基于ASReml软件包的免费辅助R包:ASRtriala,软件包充分利用ASReml灵活的功能,可以分析多环境试验(MET)的数据,包括空间分析、GxE分析等。
ASRtriala可以使用单阶段分析(Single-stage analysis),它可以通过LMM模型整合多个地点多个试验,定义单个环境特殊的矩阵结构,方便操作,一步到位选择最优模型得到BLUP值。
ASRtriala也可以分析GxE分析,包括稳定性分析、Biplot分析、FA分析等。
ASRtriala包主要功能
※ 可以分析单环境和多环境数据分析;
※依赖于ASReml的灵活性,进行多模型构建和评估;
※分析GxE效应,包括FA模型,Biplot模型等;
※多环境数据进阶分析,包括遗传力计算、稳定性分析等。
ASRtriala使用说明
它可以非常方便的进行田间数据的可视化:
它也可以计算不同遗传力的计算,包括h2,h2.vc, h2.pev等方法:
可以对多个环境进行相关性分析和可视化分析:
ASRtriala软件获取方法
1、加入QQ群:398671275
2、找到文件,本地安装(如下图所示)
ASRtriala是一个免费的R工具,旨在为植物和林木育种者提供更深入的单环境和多环境试验分析。它使田间试验分析更快、更简单、更容易进行,特别适用于累积的试验数据。
Copyright © 2015-2022 南方数据网版权所有 备案号:粤ICP备18023326号-21 联系邮箱:855 729 8@qq.com